Здравствуйте, да много что может сделать - лишить премии, например, или поставить его перед фактом, мол ещё раз опоздаешь - уволю. Но если у начальника опаздывает не один человек, а много, стоит пересмотреть учёт рабочего времени в целом, сейчас есть системы учета рабочего времени, например как
https://www.getworkpoint.ru/features/re ... management она так работает, что с ней ни один работник САМ не захочет опаздывать. Рекомендую взглянуть.